Katrin Eggenberger begann ihre berufliche Laufbahn 2002 schon während der Schulzeit mit einem einjährigen Praktikum bei der LGT Bank in Liechtenstein. Es folgten Positionen im Private Banking und Portfolio Management bei der VP Bank (2004–2008) sowie als Leiterin des fondsgestützten Vermögensverwaltungsgeschäfts bei der Notenstein Privatbank (2008–2014), wo sie auch Mitglied der Direktion war. Von 2016 bis 2019 arbeitete sie beim World Economic Forum (WEF) in Führungsfunktionen, unter anderem als Chief of Staff sowie als Verantwortliche für die Community of Chairpersons und den Aufbau der Innovationsplattform UpLink. Katrin Eggenberger promovierte 2019 an der Universität St. Gallen (HSG) in Staatswissenschaften mit einer Doktorarbeit über Steuern, Sanktionen und Extrateritorialität, betreut unter anderem von Nobelpreisträger Joseph E. Stiglitz. Zwischen 2019 und 2021 war sie Ministerin für Äusseres, Justiz und Kultur des Fürstentums Liechtenstein. Anschliessend war sie von 2022 bis 2023 als Senior Advisor im Bereich Transport und Infrastrukturtechnologie bei der Inter-American Development Bank (IDB) in Washington, D.C. tätig.

Seit 2021 ist sie Senior Advisor bei der Agora Strategy Group (Deutschland), Verwaltungsrätin und Chief Strategist bei AISquare Inc. (USA), Verwaltungsratspräsidentin bei CIOS (Schweiz), Verwaltungsrätin bei Deon Digital AG (Schweiz und Dänemark) sowie Präsidentin AdBoard Ost bei der Implenia (Schweiz). Zudem engagiert sie sich als Stiftungsrätin bei der Pro Futura Stiftung für Jugend und beim Kultur und Kongresszentrum Verrucano in der Schweiz.